La investigación-innovación al servicio de la sociedad es uno de los grandes pilares de la Universidad. La gran mayoría de los profesores de la UEMF son docentes-investigadores y su desarrollo profesional se basa en gran medida en su producción científica.
La UEMF dispone de una infraestructura de investigación de altísimo nivel y determinadas instalaciones son únicas en Marruecos como la plataforma de fabricación aditiva (impresión 3D) , la plataforma digital , etc.
La UEMF es actualmente la Universidad marroquí que tiene los contratos de investigación más importantes con el mundo socioeconómico, incluidos los sectores de la aeronáutica, el automóvil, las energías renovables, la agroindustria, la digitalización, la biomedicina, la planificación territorial, el patrimonio cultural y las cuestiones de la Unión Europea. Zona Mediterráneo-África.
La investigación dentro de la UEMF es realizada por docentes-investigadores altamente calificados y reconocidos por su producción científica , y por estudiantes de doctorado y posdoctorado de diferentes nacionalidades.